通常の授業は行っていませんが、学校行事、定期試験、模擬試験が入ることもあります。

本校では、生徒たちの登下校時の安全面を考え、許可制で携帯電話の所持を認めています。所持している生徒については、担任が朝礼時に集め、終礼時に返しています。

百合学院には併設の大学はありませんが数多くの指定校推薦大学があります。一人ひとりの進路目標に合わせ、幅広い学部・学科への進学が可能となっています。約90％以上が第1希望の推薦枠を取得しています。

本校では居住地により自転車通学を許可しています。尼崎市内に住む生徒はもちろんのこと、学校のある尼崎市近隣の豊中市や伊丹市などから自転車で通学している生徒もいます。基本は自転車通学で、雨の場合や荷物が多い時のみ、電車やバスを利用するというように通学方法を変えている生徒もいます。

現在、阪神・JR 尼崎駅と阪急園田駅から学校までスクールバスが出ています。学期毎での定期券や1回毎で使用できる回数券もありますので、暗くなるのが早い冬季や雨の場合のみスクールバスを利用することも可能です。

校門には警備員が常駐し、校内の巡回も随時行っています。